Отделение хирургического лечения легочного и внелегочного туберкулеза развернуто на 30 коек. Со дня своего основания до настоящего времени основной задачей отделения является совершенствование методов диагностики и оказания хирургических вмешательств  больным  при туберкулезе легких.  В отделении работают высококвалицированные хирурги, прошедшие обучение в странах ближнего зарубежья ( Москва, Ташкент,Екатеринбург, Новосибирск).
В отделении проводятся следующие виды оперативных вмешательств:
-торакоскопия с биопсией плевры
-сегментарные и комбинированные резекции леких
-лоб- и билобэктомии
-лобэктомии с одномоментной предварительной корригирующей торакопластикой
-торакопластика, торакокомиопластика
-декортикация легкого с плеврэктомией
-торакостомия
-абсцессотомия
-Лимфаденэктомия

Зав. отд:Дутбаев Б. Е. 1 тегория, стаж работы 39 лет.
Хирурги:
-Бакиров Б. А. Высшая категория, стаж работы 16 лет.
-Амиров К.Ж. Сертификат, стаж работы 17 лет.
Внелегочный фтизиатр-Шопаев Б. О. Сертификат, стаж работы 15 лет
Эндоскопист-Баймурзаев К. А. Высшая категория, стаж работы 24 года